EBP項目將首先集中完成約9330個真核生物科級別代表性物種（eukaryotic family）的基因組，從而獲得與人類參考基因組相當(dāng)或比人類參考基因組更好的參考基因組。接著，在14萬～20萬個真核生物屬（eukaryotic genera）中，對來自每個屬的一個物種進(jìn)行基因組草圖繪制。最后，對剩下的150萬個已知的真核生物物種（eukaryotic species）的基因組進(jìn)行低覆蓋測序。這些精細(xì)度不同的基總有機(jī)碳分析儀因組之間還能通過比較分析或進(jìn)一步測序，幫助我們獲知更多的信息。EBP計劃的意義重大。以Harris Lewin, Gene Robinson, John Kress為代表的EBP工作組成員表示，這是第一個真正的全球大型基因組測序項目，能讓世界上數(shù)千名科學(xué)家和數(shù)百萬民眾參與，所產(chǎn)出的超大數(shù)據(jù)超過1EB（相當(dāng)于1億部高清電影，播放2.3萬年），將推動全新計算算法、分析方法和模型的創(chuàng)立，革新我們對生物學(xué)的理解，有望極大改善物種保護(hù)工作，并為農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥和生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)創(chuàng)造新的基因資源。研究者們完成該項目的信心來源之一，是不斷下降的的測序成本與不斷進(jìn)步的測序技術(shù)。人類基因組計劃之后，個人全基因組測序成本不斷降低，由最初的30億美元下降到現(xiàn)在的1000美元，甚至可能更低。作為全球最大的基因組學(xué)研發(fā)中心，華大基因已于2015-2016年相繼推出了多款自主研發(fā)的測序系統(tǒng)，目前已具備量產(chǎn)測序儀的實力，也將運用這一優(yōu)勢，助力EBP項目的實施。